台灣現場Microbial Genomics培訓

微生物基因組學和宏基因組學結合測序技術和計算分析，以分析微生物羣落、表徵基因組，並檢測功能特性，如抗微生物耐藥性。

本次由講師指導的培訓（線上或線下）面向初學者到中級水平的研究人員和生物信息學家，他們希望進行微生物基因組學和宏基因組測序數據的實際操作分析。

通過本次培訓，參與者將能夠：

• 描述微生物基因組學中常見的測序工作流程和關鍵文件格式。
• 對原始NGS讀段進行質量控制和預處理。
• 使用基於標記和k-mer方法進行物種分類分析。
• 組裝和註釋微生物基因組和質粒。
• 檢測SNP，構建系統發育樹並解釋種羣結構。
• 預測抗微生物耐藥性基因並總結功能特徵。
• 使用Conda、Docker和基於筆記本的報告實現可重複的工作流程。

課程形式

• 介紹概念和工具的講座（20%）。
• 使用示例數據集進行實際操作（60%）。
• 開放式討論和指導分析，使參與者能夠將方法應用於自己的數據（20%）。

課程定製選項

• 如需定製專注於臨牀、環境或工業宏基因組學的研討會，請聯繫我們安排。